DNA-Marker / DNA-Leitern

Der GenLadder 50bp DNA Marker ist ideal, um die Größe von DNA zwischen 50 und 1500 Basenpaaren zu bestimmen. Der Marker besteht aus 17 Fragmenten in den Größen zwischen 50 - 1000bp im Abstand von 50bp. Die 200bp, 500bp und 1200bp-Fragmente haben eine stärkere Intensität, um eine leichtere Identifizierung zu ermöglichen. Alle Fragmente sind 'blunt-ended'. Die Fragmentgrößen (in Basenpaaren) sind 50 (ca. 30ng/5µL), 100 (ca. 27ng/5µL), 150 (ca. 30ng/5µL), 200 (2x) (ca. 67ng/5µL), 250 (ca. 25ng/5µL), 300 (ca. 20ng/5µL), 350 (ca. 18ng/5µL), 400 (ca. 27ng/5µL), 450 (ca. 23ng/5µL), 500 (2x) (ca. 67ng/5µL), 600 (ca. 20ng/5µL), 700 (ca. 23ng/5µL), 800 (ca. 27ng/5µL), 900 (ca. 30ng/5µL), 1000 (ca. 33ng/5µL), 1200 (2X) (ca. 70ng/5µL) und 1500bp (ca. 40ng/5µL). Der DNA Marker wird mit einer Konzentration von ca. 0,1mg/mL in 10mM Tris · HCl (pH8,0), 1,0mM EDTA und Farbstoff Orange G geliefert. Die empfohlene Menge Marker pro Gelspur liegt bei 0,5μg (5μL). Unsere GenLadder DNA-Marker sind in einem praktischen ready-to-us- Format, vorgemixt mit 6X Loading Dye, erhältlich: GM3094 (GenLadder 100 bp Plus ready-to-use) > und M3328 (GenLadder 1kbp ready-to-use) > oder als ready-to-use-Prämix M3072 (GenLadder 50bp) > mit 6X Orange G DNA Loading Dye.Die DNA Gel Loading Dyes können auch separat bestellt werden: M3308 (DNA Gel Loading Dye mit Bromophenolblau und Xylencyanol FF) > und M3321 (DNAGel Loading Dye mit Orange G) >.

Der Genaxxon GenLadder 100 bp Plus with loading dye ist ideal dafür geeignet die Größe doppelsträngiger DNA zwischen 100 und 1500 Basenpaaren zu bestimmen. Durch die zusätzlichen Banden bei 1.5kbp und 3.0kbp können auch zusätzlich DNA-Größen in diesem Bereich zugeordnet werden, ohne einen zusätzliche 1kbp DNA-Marker einsetzen zu müssen. Die Genladder 100 bp Plus besteht aus 12 Fragmenten in den Größen zwischen 100 - 1000bp im Abstand von 100bp. Zusätzlich gibt es bei 1500bp und 3000bp weitere Banden. Das 500bp und das 1500bp Fragment zeigen eine stärkere Intensität, um eine leichtere Identifizierung zu ermöglichen. Alle Fragmente sind 'blunt-ended'. Die Fragmentgrößen (in Basenpaaren) sind 3000 bp (40ng/5µL), 2x 1500 bp (70ng/5µL), 1000 bp (50ng/5µL), 900 bp (40ng/5µL), 800 bp (40ng/5µL), 700 bp (30ng/5µL), 600 bp (30ng/5µL), 2x 500 bp (90ng/5µL), 400 bp (40ng/5µL), 300 bp (30ng/5µL), 200 bp (40ng/5µL), 100 bp (40ng/5µL). Der DNA-Marker ist in einem ready-to-use Puffer gelöst der Orange G und Xylenecyanol FF als Tracking dyes enthält. Die Gesamtkonzentration der enthaltenen DNA beträgt 0,1µg/µL (108µg/mL). Die empfohlene Menge Marker pro Gelspur liegt bei 0,5μg (5µL). Unsere GenLadder DNA-Marker sind in einem praktischen ready-to-us- Format, vorgemixt mit 6X Loading Dye, erhältlich: GM3094 (GenLadder 100 bp Plus ready-to-use) > und M3328 (GenLadder 1kbp ready-to-use) > oder als ready-to-use-Prämix M3072 (GenLadder 50bp) > mit 6X Orange G DNA Loading Dye.Die DNA Gel Loading Dyes können auch separat bestellt werden: M3308 (DNA Gel Loading Dye mit Bromophenolblau und Xylencyanol FF) > und M3321 (DNAGel Loading Dye mit Orange G) >.

Der GenLadder 100 bp Plus mit integriertem Gelfärbefarbstoff und Loading Dye - DNA-ladder ready-to-use ist eine Innovation für Hochdurchsatzansätze oder Colony screenings! Ideal dafür geeignet die Größe doppelsträngiger DNA zwischen 100 und 1000 Basenpaaren zu bestimmen. Durch die zusätzlichen Banden bei 1.5kbp und 3.0kbp können auch zusätzlich DNA-Größen in diesem Bereich zugeordnet werden, ohne einen zusätzliche 1kbp DNA-Marker einsetzen zu müssen. Gleichzeitig enthält die Mischung auch einen Gelfärbefarbstoff. Eine zusätzliche Färbung (pre- oder post staining) oder die Zugabe von Fluoreszenzfarbstoff vor dem Auftragen ist somit hinfällig und erspart einen weiteren Pipettierschritt. Gleichzeitig kann schon vor dem Auftragen der PCR-Probe geprüft werden, ob eine PCR erfolgreich war oder nicht. Diese DNA-Ladder passt ideal zu unserem Red Mastermix Fluoro 2X, der den Gelfärbefarbstoff ebenfalls enthält. Zusammen das ideale Paar für Colony Screens! Für mehr Informationen zu unseren SimplyEnlight PCR-Produkten lesen Sie jetzt unseren Blogbeitrag. Genaxxon's SimplyEnlight PCR - Unlock the Power of Your PCR! Der GenLadder 100 bp Plus mit Fluroeszenzfarbstoff und Loading Dye - ready-to-use besteht aus 12 Fragmenten in den Größen zwischen 100 - 1000bp im Abstand von 100bp. Zusätzlich gibt es bei 1500bp und 3000bp weitere Banden. Das 500bp und das 1500bp Fragment zeigen eine stärkere Intensität, um eine leichtere Identifizierung zu ermöglichen. Alle Fragmente sind 'blunt-ended'. Die Fragmentgrößen (in Basenpaaren) sind 3000 bp (40ng/6µL), 2x 1500 bp (70ng/6µL), 1000 bp (50ng/6µL), 900 bp (40ng/6µL), 800 bp (40ng/6µL), 700 bp (30ng/6µL), 600 bp (30ng/6µL), 2x 500 bp (90ng/6µL), 400 bp (40ng/6µL), 300 bp (30ng/6µL), 200 bp (40ng/6µL), 100 bp (40ng/6µL). Der DNA-Marker ist in einem ready-to-use Puffer gelöst der Orange G und Xylenecyanol FF als Tracking dyes enthält. Die Gesamtkonzentration der enthaltenen DNA beträgt 90 µg/mL. Die empfohlene Menge Marker pro Gelspur liegt bei 0,5μg (6µL). Unsere weiteren GenLadder DNA-Marker sind in einem praktischen ready-to-us- Format, vorgemixt mit 6X Loading Dye, erhältlich: GM3094 (GenLadder 100 bp Plus ready-to-use) > und M3328 (GenLadder 1kbp ready-to-use) > oder als ready-to-use-Prämix M3072 (GenLadder 50bp) > mit 6X Orange G DNA Loading Dye.Die DNA Gel Loading Dyes können auch separat bestellt werden: M3308 (DNA Gel Loading Dye mit Bromophenolblau und Xylencyanol FF) > und M3321 (DNAGel Loading Dye mit Orange G) >.

Mit dem GenLadder 1 kbp (ready-to-use) DNA-Marker lassen sich im Bereich von 250 - 3000 Basenpaaren mit einem Abstand von 250 bp, z. B. größere Plasmid-Insertionen und oberhalb von 3000 Basenpaaren mit einem Abstand von 1 - 2kb Vektorplasmide nach Restriktion übersichtlich und präzise in ihrer Größe gelelektrophoretisch bestimmen. Im Vergleich zu DNA-Markern mit äquimolarer Verteilung der Banden, sind bei dieser 1kb Leiter die unteren Banden bis 1000bp in ihrer Masse verstärkt, die oberen Banden ab 3000 bp reduziert. Die 1 kb Leiter erlaubt mit den zwei deutlich verstärkten Banden bei 1000 und 3000 Basenpaaren eine schnelle Orientierung im 1,0 - 1,5%igen Agarosegel. Dies ermöglicht optimale Ergebnisse bereits nach ca. 60 - 80 mm Laufstrecke im Agarosegel und niedrige Beladungsmassen von ca. 0,7μg pro Spur in normalformatigen Agarosegelen (80mL). Wiederholtes Einfrieren und Auftauen vermeiden. Wir empfehlen ein Portionieren in kleine Aliquots. Die DNA ist bereits in 6-fach, gefärbtem Ladepuffer gelöst. Fragmentgrößen und Menge an DNA pro Bande:10000bp ( 28ng/5µL), 8000bp (28ng/5µL), 6000bp (28ng/5µL), 5000bp (28ng/5µL), 4000bp ( 18ng/5µL), 2x3000bp (92ng/5µL), 2500bp (34ng/5µL), 2000bp (34ng/5µL), 1500bp (20ng/5µL), 2x1000bp (92ng/5µL), 750bp (23ng/5µL), 500bp (30ng/5µL), 250bp (45ng/5µL). Unsere GenLadder DNA-Marker sind in einem praktischen ready-to-us- Format, vorgemixt mit 6X Loading Dye, erhältlich: GM3094 (GenLadder 100 bp Plus ready-to-use) > und M3328 (GenLadder 1kbp ready-to-use) > oder als ready-to-use-Prämix M3072 (GenLadder 50bp) > mit 6X Orange G DNA Loading Dye.Die DNA Gel Loading Dyes können auch separat bestellt werden: M3308 (DNA Gel Loading Dye mit Bromophenolblau und Xylencyanol FF) > und M3321 (DNAGel Loading Dye mit Orange G) >.

Mit der synthetischen GenLadder XLarge lassen sich im Bereich von 250 - 25000 Basenpaaren auch größere Plasmid-Insertionen und Vektorplasmide nach Restriktion übersichtlich und präzise in ihrer Größe gelelektrophoretisch bestimmen. GenLadder XLarge zeigt 14 DNA Banden. Die Menge an DNA pro Auftrag (5µL) beträgt 0,52µg. Die DNA-Leiter erlaubt, mit den zwei deutlich verstärkten Banden bei 1000 und 3000 Basenpaaren, eine schnelle Orientierung im 1,0 - 1,5%igen Agarosegel. Dies ermöglicht optimale Ergebnisse bereits nach ca. 60 - 80 mm Laufstrecke im Agarosegel und niedrige Beladungsmassen von ca. 0,5μg pro Spur in normalformatigen Agarosegelen (80mL). Wiederholtes Einfrieren und Auftauen vermeiden. Wir empfehlen ein Portionieren in kleine Aliquots. Source:PCR-Produkte und Doppelsträngige DNA-Verdaus mit entsprechenden Restriktionsenzymen. Die erhaltene DNA ist mit Phenol extrahiert und mit 10mM Tris-HCl (pH8.0), 10mM EDTA äqulibriert worden. Unsere GenLadder DNA-Marker sind in einem praktischen ready-to-us- Format, vorgemixt mit 6X Loading Dye, erhältlich: GM3094 (GenLadder 100 bp Plus ready-to-use) > und M3328 (GenLadder 1kbp ready-to-use) > oder als ready-to-use-Prämix M3072 (GenLadder 50bp) > mit 6X Orange G DNA Loading Dye.Die DNA Gel Loading Dyes können auch separat bestellt werden: M3308 (DNA Gel Loading Dye mit Bromophenolblau und Xylencyanol FF) > und M3321 (DNAGel Loading Dye mit Orange G) >.

Die Vektoren pUC18/ pUC19 aus E.coli sind standardmäßig benutzte, kleine high copy number E. coli Plasmide von 2686 bp Länge. pUC19 ist identisch mit pUC18, außer dass die multiple cloning site (MCS) in umgekehrter Orientierung angeordnet ist. pUC18/19 Plasmide beinhalten: 1. das pMB1 Replikon rep, das für die Replikation des Plasmids zuständig ist (Quelle – Plasmid pBR322). Die hohe Kopienzahl des pUC Plasmids resultiert aus dem Fehlen des rop-Gens und einer Punktmutation im Replikon rep von pMB1. 2. das bla-Gen, das für die beta-Laktamase kodiert und die Resistenz gegen Ampicillin (Quelle – Plasmid pBR322) vermittelt. Es unterscheidet sich vom bla-Gen aus pBR322 durch 2 Punktmutationen. 3. die Region des E.coli lac-Operons, das die CAP-Protein Bindestelle, den Promotor Plac, die lac-Repressor Bindestelle und den 5’-terminalen Teil vom lacZ-Gens vermittelt, das für das N-terminale Ende der beta-Galaktosidase (Quelle – M13mp18/19) kodiert. Dieses Fragment, dessen Synthese durch IPTG induziert werden kann, ist zu einer intra-allelen (alpha) Komplementation mit einer vom Wirt kodierten, defekten Form der beta-Galaktosidase befähigt (Mutation - delta(lacZ)M15). In der Gegenwart von IPTG synthetisieren die Bakterien beide Fragmente des Enzyms und bilden blaue Kolonien auf Medien, die X-Gal enthalten. Die Insertion von DNA in die MCS, die inmitten des lacZ Gens liegt (Codons 6-7 des lacZ Gens wurden durch die MCS ersetzt), inaktiviert das N-terminale Fragment der beta-Galaktosidase und verhindert die alpha-Komplementation. Die Bakterien, die rekombinante Plasmide enthalten, bilden deshalb weiße Kolonien auf Medien mit X-Gal.

Phage Lambda cl857 Sam7 DNA wird aus dem infizierten E. coli Stamm W3350 isoliert. Die durch das Restriktionsenzym verdaute Lambda DNA (48.502 bp) liefert Molekulargewichtsmarker, die routinemäßig bei der Analyse mittels Gelelektrophorese von Nukleinsäuren verwendet wird. Die komplette Nukleotidsequenz der Lambda DNA wurde bestimmt. Die DNA wird im Aufbewahrungspuffer geliefert (10mM Tris · HCl (pH7,4), 10mM NaCl, 1mM EDTA). Beschreibung/DNA-Präparation: Die doppelsträngige DNA wird aus dem Bakterionphagen Lambda (cl857 ind1 Sam7) isoliert. Das Molekulargewicht liegt bei 31.5 x 10E6 Dalton. Die DNA hat eine Länge von 48.502 Basenpaaren.Der Phage wird durch Gelfiltration aus dem hitzeinduzierbaren Lysogen E. coli λ cl857 S7 isoliert. Die DNA wird aus den gereinigten Phagen durch Phenol/Chloroform-Extraktion isoliert und gegen 10mM Tris-HCl (pH7,4) und 1mM EDTA dialysiert. The product is methylated.