Acridinorange hemi(Zinkchlorid) Salz (C.I. 46005)

Acridinorange ist ein fluorochromer Farbstoff für die selektive Färbung von Tumoren. Als Färbemittel für RNA in PAGE wird eine 2%ige Lösung in 15% Essigsäure mit 1% Lanthanacetat eingesetzt. Acridinorgange findet auch Anwendung in der Flow-Zytometrie, wegen der Fähigkeit Einzel- und Doppelstrang Nukleinsäuren unterschiedlich anzufärben.

Bei Acridinorange handelt es sich um eine stark kanzerogene Substanz (Tyrer H.W. et al. (1979) J. Histochem. Cytochem. 27, 552-6). Acridinorange wird z. B. zur differentiellen Färbung von DNA und RNA verwendet. Bei Anregung mit blauem Licht fluoresziert doppelsträngige DNA nach Interkalation von Acridinorange grün (max. Emission 530 nm). Einzelsträngige Nukleinsäuren kondensieren und präzipitieren nach Interaktion mit dem Farbstoff. Sie lumineszieren im roten Wellenlängenbereich (max. Emission 640 nm).

Bei der differentiellen Färbung von RNA und DNA ist zu beachten, dass eine zu hohe Acridinorange-Konzentration zu einer Denaturierung der DNA führt, während zu niedrige Konzentrationen dsRNA unvollständig denaturieren. Für Zellen mit hohem RNA-Gehalt muss die Acridinorange-Konzentration erhöht werden. Eine definierte Arbeitskonzentration läßt sich also kaum empfehlen. Als Stammlösung eignet sich eine Lösung (1mg/mL) in bidestilliertem Wasser. Die Arbeitskonzentration liegt bei ca. 13μM (4μg/mL). Die Stammlösung ist lichtgeschützt bei +4°C mehrere Monate ohne Qualitätsverlust lagerbar.