TAE buffer (10-fach) gebrauchsfertige Lösung

TAE-Puffer ist der gängigste Laufpuffer für Agarosegele. Ursprünglich wurde der Puffer für die Polyacrylamidgelelektrophorese, mit leicht unterschiedlicher Pufferzusammensetzung entwickelt (40mM Tris; 20mM NaOAc; 2mM EDTA-Na2; pH7.8). Um die Sekundärstruktur von RNA zu stabilisieren, wurde Natriumacetat benutzt. 

Heutzutage wird TAE in einer modifizierten Zusammensetzung (40mM Tris-acetate; 1mM EDTA-Na2; pH ca. 8.5 at room temperature). TAE besitzt eine geringere Pufferkapazität als TBE, aber doppelsträngige, lineare DNA bewegt sich ca. 10% schneller bei TAE-Puffer als bei TBE-Puffer bei gleichzeitig vergleichbarer Auftrennung. Die Auftrennung von supercoiled DNA ist in TAE besser als in TBE. Durch die geringere Pufferkapazität wird TAE-Puffer über die Zeit bei hohen Strömen ausgelaugt und muss daher immer wieder ersetzt werden. Ein großer Vorteil von TAE gegenüber TBE ist in der fehlenden Interaktion mit Agarose zu sehen, was zu einer höheren Ausbeute an Nukleinsäure in präparativen Agarosegelen führt. 

Normalerweise wird TAE als 50-fach Konzentrat hergestellt und als 1-fach oder 0,5-fach konzentrierte Lösung in der Elektrophorese eingesetzt.