Agarose LE - Standard Agarose



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Agarose LE is a standard agarose for the separation of DNA in the size range between 50bp and... more
Product information "Agarose LE - Standard Agarose"

Agarose LE is a standard agarose for the separation of DNA in the size range between 50bp and 20kbp. It is suitable for all analytical and preparative electrophoresis of nucleic acids in routine gel electrophoresis. Depending on the concentration of Agarose LE used, the size range of nucleic acid separation will vary between 50bp and 20kbp. The low EEO makes this useful for a broad range of applications: PCR product analysis, restriction enzyme digest analysis, separation of RNA before blotting, etc.

This agarose is comparable with, e.g. Agarose BioRagent, low EEO from Sigma or with the Universal-Agarose, peqGOLD from Peqlab. Free Taq DNA Polymerase test sample available! No shipping costs within Germany.

Genaxxon offers Agaroses for different purposes. Two melting point options and normal or high resolution separation of DNA fragments are available.

Standard normal melting agarose M3044 with standard resolution used in routine DNA electrophoresis for separation of a wide range of DNA fragments from 50bp up to 20kbp. This agarose is available as powder (M3044 Agarose LE >) or as high-quality, multi-purpose tablets (M3054 >) available in blister packaging in 200 or 1,000 tablet quantities. They are compact, pre-weight and therefore easy-to-use.
Low melting/gelling temperature agarose recommended for rapid DNA gel extraction with the agarose-digesting enzyme, Agarase (S5223) >, as well as for "in-gel" DNA treatment with enzymes or for bacterial transformation with nucleic acids directly after re-melting the gel.

High resolution agarose (normal melting or low melting) for high resolution elektrophoresis to differentiate DNA fragments with only 2 bp size difference: M3046 Agarose Tiny > (low melt, high resolution comparable to NuSieve®), M3048 Agarose Tiny LMH > (normal melting point, high resolution) or M3047 Agarose Tiny HT > (high gel strength, high resolution comparable to SeaKem®).

For the nontoxic staining of nucleic acids in agarose gels the highly sensitive fluorescent dye GelRed® (M3199) > is recommended.

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Our comment on "Agarose LE - Standard Agarose"
- Standard Melting Point - 100 bp to >20 kb - low EEO
Specifications: Electroendosmosis (EEO): <0.12 Sulfate: <0.1% Gel strength (1.0%):... more
 

Technical Data:

Specifications:
Electroendosmosis (EEO): <0.12
Sulfate: <0.1%
Gel strength (1.0%): >1200 g/cm2
Gel strength (1.5%): >2300 g/cm2
Gelling temperature: +36°C (+/- 1.5°C)
Melting temperature: <89°C
Water content: <10%
pH-value in water: 6.0 to 7.0 (1% in water)
DNAses and RNAses: not detected.
DNA binding: not detected

application:

For analytical and preparative DNA gel electrophoresis

Source

seaweed

Sicherheits Hinweise / Safety

Klassifizierungen / Classification

EC-Nr: 232-731-8
CAS-Nr: 9012-36-6
eclass-Nr: 32-16-04-03
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Kurzanleitung für ein Standard-Agarosegel (2%-ig, 100mL)

  • 2g Agarose LE in ein hitzebeständiges Gefäß einwiegen.
  • In einem 1-L-Kolben eine 1%-ige TAE-Lösung herstellen (z.B. 20mL 50X gebrauchsfertige TAE-Pufferlösung > auf 1000mL Aqua dest. auffüllen), gut verrühren.
  • Von dieser Lösung 100mL zu der Agarose geben, leicht schwenken, bis sich die Agarose in der Flüssigkeit verteilt hat.
  • Diese Agaroselösung vorsichtig in kurzen Intervallen in der Mikrowelle erhitzen, bis sich die Agarose vollständig gelöst hat. Es entsteht eine klare Lösung.
  • Vorsicht: Die Lösung kann beim Erhitzen leicht überkochen, immer beobachten und kurze Intervalle wählen!
  • Vorsicht: Lösung wird sehr heiß, Handschuhe verwenden! Siedeverzug vermeiden! Schutzbrille tragen!
  • Die Lösung sollte auf ca. 50-60°C abgekühlt werden (Glas kann gerade noch angefasst werden).
  • Je nach Anwendung wird ein Gelfarbstoff, z.B. GelRedTM > (3,5-10µL je nach geünschter Intensität der Banden,) in das Gel gegeben und gleichmäßig verteilt.
  • Die Lösung wird nun vorsichtig in den vorbereiteten Schlitten (mit Kamm) einer Elektrophoresekammer gegossen.
  • Vorsicht: Wenn die Gellösung noch zu heiß ist, besteht die Gefahr, dass sie durch ungenügend abgedichtete Ritzen des Schlittens ausläuft oder der Schlitten bricht! Bei zu stark abgekühlter Lösung geliert das Gel bereits!
  • Das Gel für ca. 1 Stunde erstarren lassen.
  • Der Rest des 1X TAE-Puffers wird in die vorbereitete Elektrophoresekammer gegeben und das Gel mit Schlitten in die entsprechende Position gelegt (Taschen sind oben). Das Gel muss vollständig mit Flüssigkeit bedeckt sein. Der Kamm wird vor der Elektrophorese gezogen.
  • Vor dem Auftragen der Proben wird ein Spülen der Taschen mit dem Laufpuffer empfohlen, um Gelreste zu entfernen.
  • Wichtig: Die TAE-Konzentration des Elektrophoresepuffers (Laufpuffer) muss mit der Konzentration im Gel übereinstimmen!
  • Das PCR-Produkt wird mit Ladepuffer (z.B. DNA Ladepuffer I >) gemischt (6X-Ladepuffer: 5µL Produkt + 1µL Ladepuffer) und vorsichtig in die Taschen gegeben.
  • Der Schritt des Mischens mit einem Ladepuffer entfällt bei Verwendung von einem Mastermix in der PCR, bei dem bereits ein Ladepuffer integriert ist (z.B. Genaxxons RedMasterMix 2X Taq PCR Mastermix mit rotem Farbstoff >).
  • Es wird das zusätzliche Auftragen eines DNA-Größenmarkers empfohlen (z.B. GenLadder 100bp + 1.5kb, ready-to-use >), ca. 5-6µL pro Bahn.
  • Je nach Vorgaben des Geräteherstellers kann die Gelelektrophorese nun nach Anbringen der Elektroden gestartet werden. Die negativ geladene DNA wird in Richtung des positiven Pols wandern.
    Beispiel: 120V, 160 mA, 50W.
    Die Laufzeit richtet sich nach dem gewünschten Ergebnis (durchschnittlich 0,5-1 Stunde). Mit einem Fotodokumentationsgerät kann das Ergebnis festgehalten werden.
 
 
 
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Referenzen..

Hier finden Sie Artikel und Literaturzitate, in denen die Autoren auf die hohe Qualität dieses Genaxxonprodukts vertrauen.

Listed below are articles and references, in which the authors trust in the high quality of this Genaxxon product.

Quelle/Source: NCBI PubMed >

Induced Variations in Brassinosteroid Genes Define Barley Height and Sturdiness, and Expand the Green Revolution Genetic Toolkit

Christoph Dockter, Damian Gruszka, Ilka Braumann, Arnis Druka, Ilze Druka, Jerome Franckowiak, Simon P. Gough, Anna Janeczko, Marzena Kurowska, Joakim Lundqvist, Udda Lundqvist, Marek Marzec, Izabela Matyszczak, André H. Müller, Jana Oklestkova, Burkhard Schulz, Shakhira Zakhrabekova, Mats Hansson

Plant Physiol. 2014 Dec; 166(4): 1912–1927.  Published online 2014 Oct 20. doi: 10.1104/pp.114.250738

PMCID: PMC4256852

The role of rotavirus associated with pediatric gastroenteritis in a general hospital in Lagos, Nigeria

Philip Ifesinachi Anochie, Edwina Chinwe Onyeneke, Emmanuel Osaretin Asowata, Ebelechukwu Afocha, Anthony Chidiebere Onyeozirila, Angelina Chinyere Ogu, Bestman Chukwuemeka Onyeneke

Germs. 2013 Sep; 3(3): 81–89. Published online 2013 Sep 1. doi: 10.11599/germs.2013.1041

PMCID: PMC3882862

Connectivity from OR37 expressing olfactory sensory neurons to distinct cell types in the hypothalamus

Andrea Bader, Bettina Klein, Heinz Breer, Jörg Strotmann

Front Neural Circuits. 2012; 6: 84.  Prepublished online 2012 Oct 16. Published online 2012 Nov 16. doi: 10.3389/fncir.2012.00084

PMCID: PMC3499762