SNP PolTaq DNA-Polymerase



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Produktinformationen "SNP PolTaq DNA-Polymerase"

SNP Pol DNA-Polymerase für die einfache, verlässliche und schnelle allelspezifische Diskriminierung, z. B. von CRISPR/Cas9-gesetzten Punktmutationen, für das Erkennen falscher CRISPR/Cas9-Produkte oder zur Validierung von Sequenzierergebnissen. Die SNP Pol DNA-Polymerase unterscheidet hochspezifisch, ob eine Fehlpaarung (Mismatch) des Primer-Template-Komplexes vorliegt oder nicht. Die Fehlpaarung (Punktmutation) muss sich am 3´-Ende des Primers befinden. Somit können mutante Allele exakt von Wildtypallelen unterschieden werden - ohne Sequenzierung, da die Polymerase im Fall einer Fehlpaarung schlichtweg nicht amplifiziert. 

Die Variante SNP PolTaq DNA-Polymerase > besitzt 5'-3'-Nukleaseaktivität und kann daher mit spezifischen Primersonden wie Taqman® Sonden oder Molecular beacons eingesetzt werden.

Einmaliges Testmuster zum Sonderpreis erhältlich! Keine Versandkosten bei Versand innerhalb Deutschlands! Der Testmusterpreis wird bei der ersten offiziellen Bestellung des Produkts zurückerstattet.

Beschreibung

Die SNP Pol DNA-Polymerase (High Discrimination of single nucleotides) ist eine hochselektive DNA-Polymerase. Sie wurde speziell für die allelspezifische Diskriminierung entwickelt, bei der eine sehr hohe Unterscheidungsrate (high discrimination) benötigt wird: Z.B. bei der Allelspezifischen PCR (ASA; AS-PCR), Allelspezifischen Primerextension (AS-PEX), SNP Analyse, Genotypisierung oder bei methylierungsspezifischen PCRs (MSP). Viele DNA-Polymerasen tolerieren fehlgepaarte Primer-Template Komplexe. Die SNP Pol DNA-Polymerase dagegen unterscheidet diese spezifisch (high discrimination) und liefert gezielt nur PCR-Produkte bei perfekt passenden Primerpaaren! Die Genaxxon SNP Pol und SNP PolTaq DNA-Polymerasen unterscheiden bis zu 100% mittels allelspezifischer PCR zwischen den beiden Allelen und ergeben nach einer simplen qPCR eine eindeutige Aussage, welches Allel vorliegt. Somit kann das prinzipiell große Potential der CRISPR/Cas9 Technologie mit der SNP PolTaq bzw. der SNP Pol DNA-Polymerase für die Humanmedizin und Pflanzenbiotechnologie genutzt werden.

Mittels allelspezifischer PCR kann man die Mutationsrate in einem Pool oder Hintergrund von Wildtyp-Sequenzen quantifizieren. Auch die Überprüfung von Mutationshäufigkeiten, die durch NGS bestimmt wurden, kann mittels allelspezifischer PCR und SNP Pol DNA-Polymerase verifiziert werden. Sehr gut geeignet ist die SNP PolTaq DNA-Polymerase zur Analyse von Liquid Biopsie Proben. Mit ihr kann die Anwesenheit und Häufigkeit von Krebsmutationen sehr gut analysiert und quantifiziert werden.

Wir empfehlen die Anwendung von Primern für kurze Amplicons (ca. 60-200 bp) für optimale Ergebnisse. Längere Amplicons sind ebenfalls möglich. Bei längeren Amplicons >500 bp ist unter Umständen der Zusatz von Magnesium (+0.5 - 1.5mM) erforderlich.

Die SNP Pol DNA-Polymerase (M3009 > oder M3061 >) kann zusammen mit unspezifischen Fluoreszenzfarbstoffen (z.B. Green DNA Dye > von Genaxxon oder SybrGreen®) in der realtime PCR eingesetzt werden. Wenn mit spezifischen PCR-Probes gearbeitet wird, ist nur die SNP PolTaq DNA-Polymerase dafür einsetzbar, da nur diese eine 5'-3' Exonukleaseaktivität besitzt.

Mit unseren hochwertigen dNTPs als Set (M3015.4100 und M3015.0250) > oder als Mix (M3016.1010) > oder unseren DNA-Markern > und unserer günstigen Standardagarose > bieten wir Ihnen weitere Produkte für die PCR.

Anwendungsgebiete für die SNP Pol DNA-Polymerase
- Monitoring, verification and detection of point mutations
- Identification of correct or wrong CRISPR/Cas9 products
- Verification/validation of sequencing results
- Quantification of mutations (e.g. NGS results)
- SNP-detection by allele-specific amplification (ASA) / Allele-specific PCR
- Methylation specific PCRs (MSP) after bisulfite treated DNA (CpG methylation sides)
- HLA genotyping
- micro sequencing
- realtime PCR with hydrolysis probes
- realtime multiplex PCRs

- DamID-seq data in C. elegans.

Sharma R, Ritler D, Meister P.
Tools for DNA adenine methyltransferase identification analysis of nuclear organization during C. elegans development. Genesis. 2016 Feb 4. doi: 10.1002/dvg.22925.

- Minisequencing SNP genotyping with SNPase DNA Polymerase can be carried out by the procedure described in:

Lovmar L, Fredriksson M, Liljedahl U, Sigurdsson S, Syvänen AC. 
Quantitative evaluation by minisequencing and microarrays reveals accurate multiplexed SNP genotyping of whole genome amplified DNA. Nucleic Acids Res. 2003;31:e129.

- Allel specific mismatch selectivity by the HiDi DNA polymerase

Drum M, Kranaster R, Ewald C, Blasczyk R, Marx A (2014) Variants of a Thermus aquaticus DNA Polymerase with Increased Selectivity for Applications in Allele- and Methylation-Specific Amplification. PLoS ONE 9(5): e96640. doi:10.1371/journal.pone.0096640

 

> häufig gestellte Fragen (FAQs)

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Unser Kommentar zu "SNP PolTaq DNA-Polymerase"
high single nucleotide discrimination
SNP PolTaq DNA polymerase is supplied as a 5 U/µL solution. It comes together with an optimized... mehr
 

Technische Daten:

SNP PolTaq DNA polymerase is supplied as a 5 U/µL solution. It comes together with an optimized 10X reaction buffer.

SNP PolTaq DNA polymerase posses 5’-3’ exonuclease activity! This enzyme can be used together with hydrolysis probes like, e.g. TagMan probes.

Applikation:

- Monitoring, verification and detection of point mutations - Identification of correct or wrong CRISPR/Cas9 products - Verification/validation of sequencing results - Quantification of mutations (e.g. NGS results) - SNP-detection by allele-specific amplification (ASA) / Allele-specific PCR - Methylation specific PCRs (MSP) after bisulfite treated DNA - HLA genotyping - micro sequencing - realtime PCR with hydrolysis probes - realtime multiplex PCRs

Quelle

rec. from E.coli

Sicherheits Hinweise / Safety

Klassifizierungen / Classification

eclass-Nr: 34-16-04-90
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Kann man die SNP Pol DNA-Polymerase mit Bisulfit-behandelten DNA-Proben verwenden?

Ja, unsere SNP Pol DNA-Polymerase ist beispielsweise hervorragend geeignet für die methylierungsspezifische PCR (MSP). Da eine einzelne Fehlpaarung für bestimmte MSP-Ergebnisse ausreicht, ermöglicht SNP Pol DNA-Polymerase sogar eine zuverlässige MSP-Analyse einzelner CpG-Stellen.

Kann man SNP Pol 2x PCR Master Mix und SNP Pol DNA-Polymerase in auf Sonden basierenden Assays verwenden?

Ja, das ist möglich, solange keine Nukleaseaktivität erforderlich ist. Bitte beachten Sie, dass SNP Pol DNA-Polymerase keine 5'-3'-Nuklease-Aktivität aufweist. SNP Pol 2x-PCR Master Mix kann nicht in hydrolysebasierten Sondenassays (z. B. TaqMan®) verwendet werden. Für diese Assays empfehlen wir die Verwendung unserer SNP PolTaq DNA-Polymerase mit 5'-3'-Nuklease-Aktivität. Die SNP PolTaq-Variante kann daher für auf Hydrolysesonden-basierenden Real Time-PCRs verwendet werden.

Was ist die Fehlerrate von SNP Pol DNA-Polymerase?

Die Fehlerrate von SNP Pol ist vergleichbar mit der Fehlerrate von Wildtyp-Taq DNA-Polymerase.

Kann man SNP Pol DNA-Polymerase in Real Time-PCRs mit einem qPCR-Farbstoff wie SYBR® Green verwenden?

Bitte beachten Sie, dass SNP PolTaq DNA-Polymerase nicht für Real Time-PCR mit einem qPCR-Farbstoff geeignet ist. SNP Pol DNA-Polymerase funktioniert sehr gut mit qPCR-Farbstoffen.

Für welche Amplikonlänge sollten Primer ausgelegt werden?

Wir empfehlen, Primer mit einer kurzen Amplikonlänge (ca. 60-200 bp) zu entwerfen, um optimale Ergebnisse zu erzielen. Es sind jedoch auch längere Amplikonlängen möglich.

 
 
 
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