InhibiCore Rapid Plant DNA Q-Extraction PCR Kit

Direkt-PCR aus Pflanzenproben – schnell, robust und inhibitorresistent

Das InhibiCore Rapid Plant DNA Q-Extraction PCR Kit ist eine optimierte Komplettlösung für die schnelle DNA-Analyse aus Pflanzenmaterial. Das Kit kombiniert die leistungsstarke Plant DNA Q-Extraction Solution (M3230) mit dem hochrobusten InhibiCore Rapid Plant PCR MasterMix (5X) (M3250) und ermöglicht so einen durchgängigen Workflow von der Probenvorbereitung bis zur zuverlässigen qPCR-Analyse.

Pflanzenproben enthalten häufig PCR-Inhibitoren wie Polyphenole, Polysaccharide und sekundäre Pflanzenstoffe. Das Kit wurde speziell entwickelt, um diese Herausforderungen zu überwinden und selbst aus schwierigen Pflanzenmatrizes reproduzierbare und hochsensitive qPCR-Ergebnisse zu liefern.

Die Plant DNA Q-Extraction Solution ermöglicht eine schnelle und effiziente DNA-Freisetzung (8 Minuten Protokoll!) ohne aufwändige klassische Extraktionsverfahren. In Kombination mit dem inhibitorresistenten PCR Master Mix entsteht ein nahtloser Direct-PCR-Workflow, der Zeit spart und die Anzahl der Arbeitsschritte deutlich reduziert.

Der enthaltene InhibiCore Rapid Plant PCR MasterMix (5X) basiert auf einer modifizierten HotStart Taq DNA Polymerase und gewährleistet höchste Spezifität, Sensitivität und Robustheit. Dank seiner außergewöhnlichen Inhibitortoleranz eignet sich das System ideal für anspruchsvolle Anwendungen in Forschung, Agrarbiologie und Qualitätskontrolle.

Der Mix ist zudem lyophilisierungsgeeignet (lyo-ready) und enthält dUTP für optionales Kontaminationsmanagement in Kombination mit UDG (Uracil-DNA-Glykosylase). Die HotStart-Polymerase ermöglicht ein einfaches Setup bei Raumtemperatur ohne Kühlung oder Aktivierungsschritt.

Ihre Vorteile auf einen Blick

• Komplettlösung für schnelle Direkt-PCR aus Pflanzenmaterial
• Nahtloser Workflow: DNA-Extraktion + qPCR in einem System
• Hohe Inhibitortoleranz für robuste Amplifikation aus Pflanzenproben
• Schnelle und einfache Probenvorbereitung ohne klassische DNA-Isolation
• Hohe Sensitivität und Spezifität für zuverlässige Ergebnisse

Typische Anwendungen

• Pflanzengenotypisierung 
• GMO- und Transgen-Nachweis 
• Agrar- und Pflanzenforschung 
• Pflanzenpathogen-Detektion 
• Saatgut- und Qualitätskontrolle 
• High-throughput Direct-PCR aus Pflanzenmaterial

Anwendungsbeispiele:

1. Sensitive qPCR-Analyse von Chlorophyll-Genen aus Weizenlysaten

Die zuverlässige und sensitive Detektion von Chlorophyll-Gen-Targets aus Pflanzenlysaten wurde mittels qPCR unter Verwendung des InhibiCore Rapid Plant PCR MasterMix (5X) gezeigt. Dabei wurde eine Verdünnungsreihe von Weizenlysat (10 % bis 0,001 %), vorbereitet mittels der Plant DNA Q-Extraction Solution (M3230), eingesetzt, um Sensitivität und Inhibitortoleranz zu evaluieren.

Trotz hoher Lysatkonzentrationen konnte in allen Verdünnungen eine erfolgreiche Amplifikation nachgewiesen werden, was die hohe Robustheit gegenüber pflanzlichen Inhibitoren bestätigt. Eine einzelne, spezifische Schmelzkurve ohne unspezifische Produkte unterstreicht die hohe Assay-Spezifität. Die Proben wurden mit dem schnellen 8-Minuten-Protokoll der Plant DNA Q-Extraction Solution vorbereitet - eine effiziente DNA-Gewinnung ohne klassische Aufreinigungsschritte.

2. Benchmark der Direct-PCR-Leistung aus 10 % Tomatenlysat

Die Performance des InhibiCore Rapid Plant PCR MasterMix (5X) wurde im Vergleich zu drei konkurrierenden Mastermixen für die qPCR aus 10 % Tomatenlysat getestet. Die Proben wurden mit der Plant DNA Q-Extraction Solution vorbereitet und mittels Fluoreszenzdetektion im FAM-Kanal analysiert.
Der InhibiCore Master Mix zeigte eine erfolgreiche Amplifikation mit früher Ct-Detektion und damit die höchste Effizienz sowie beste Inhibitortoleranz im Vergleich zu den getesteten Konkurrenzprodukten. Zwei der Vergleichsmischungen zeigten ebenfalls Amplifikation, während zwei Systeme keine signifikanten Signale aufgrund starker Inhibition lieferten. Die Spezifität der Amplifikation wurde durch eine einzelne, klare Schmelzkurve ohne unspezifische Produkte bestätigt.

Abbildung 2: Direct-PCR aus Pflanzenproben – Benchmark der Inhibitorwirkung in Tomatenlysat
Die Direct-PCR wurde unter folgenden Zyklusbedingungen durchgeführt: 95 °C für 3 min, gefolgt von 40 Zyklen mit 95 °C für 10 s und 60 °C für 30 s, anschließend Schmelzkurvenanalyse.
Der InhibiCore Rapid Plant PCR MasterMix (5X) sowie Competitor N zeigten erfolgreiche Amplifikation, während Competitor T und Competitor Q stark inhibiert waren und keine zuverlässigen Amplifikationskurven lieferten. Der InhibiCore Rapid Plant PCR MasterMix (5X) zeigte den frühesten Ct-Wert aller getesteten Systeme und damit die höchste Toleranz gegenüber pflanzlichen PCR-Inhibitoren sowie die beste Performance.