InhibiCore Rapid Plant PCR MasterMix (5X)

Schnelle und zuverlässige qPCR aus Pflanzenmaterial

Der InhibiCore Rapid Plant PCR MasterMix (5X) wurde speziell für die schnelle und zuverlässige qPCR aus Pflanzenproben entwickelt. 

Pflanzenmaterial enthält häufig PCR-hemmende Substanzen wie Polyphenole, Polysaccharide oder sekundäre Pflanzenstoffe, die die Amplifikation beeinträchtigen können. Dank seiner außergewöhnlich hohen Inhibitortoleranz ermöglicht der InhibiCore Rapid Plant PCR MasterMix eine robuste und reproduzierbare Amplifikation selbst aus anspruchsvollen Pflanzenproben.

Die enthaltene modifizierte HotStart Taq DNA Polymerase sorgt für maximale Spezifität und Sensitivität, reduziert unspezifische Amplifikationen und gewährleistet zuverlässige Ergebnisse – auch bei schwierigen Targets. Der Master Mix enthält bereits einen optimierten PCR-Puffer, dNTPs und MgCl₂, wodurch eine schnelle und komfortable Reaktionsvorbereitung möglich wird. Die HotStart-Polymerase bleibt bei Raumtemperatur inaktiv, sodass kein gekühlter Ansatz erforderlich ist. Dies vereinfacht den Workflow und minimiert das Risiko unspezifischer PCR-Produkte.

Darüber hinaus ist der Master Mix lyophilisierungsgeeignet (lyo-ready) und damit ideal für die Entwicklung stabiler PCR- und qPCR-Assays mit Lagerung bei Raumtemperatur. Durch die Integration von dUTP kann in Kombination mit UDG (Uracil-DNA-Glykosylase) eine effektive Carry-over-Kontaminationskontrolle implementiert werden.

Für besonders schnelle Direct-PCR-Workflows wird unser InhibiCore Rapid Plant DNA Q-Extraction PCR Kit (M3252) empfohlen. Diese ermöglicht eine effiziente Probenvorbereitung aus Pflanzenmaterial und lässt sich nahtlos in nachgelagerte qPCR-Anwendungen integrieren.

Ihre Vorteile auf einen Blick

• Speziell entwickelt für Pflanzenproben und inhibitorreiche Pflanzenmatrizes
• Hohe Inhibitortoleranz für zuverlässige Amplifikation aus anspruchsvollem Pflanzenmaterial
• Hohe Sensitivität und Spezifität für präzise Ergebnisse
• Raumtemperatur-Setup dank HotStart-Technologie
• Lyo-ready und dUTP-basiertes Kontaminationsmanagement

Typische Anwendungen

• Pflanzengenotypisierung 
• Nachweis von Pflanzenpathogenen 
• Agrar- und Pflanzenforschung 
• GMO-Analysen 
• Saatgut- und Qualitätskontrolle 
• Direct-PCR aus Pflanzenmaterial

Anwendungsbeispiele:

1. Sensitive qPCR-Analyse von Chlorophyll-Genen aus Weizenlysaten

Die zuverlässige und sensitive Detektion von Chlorophyll-Gen-Targets aus Pflanzenlysaten wurde mittels qPCR unter Verwendung des InhibiCore Rapid Plant PCR MasterMix (5X) gezeigt. Dabei wurde eine Verdünnungsreihe von Weizenlysat (10 % bis 0,001 %), vorbereitet mittels der Plant DNA Q-Extraction Solution (M3230), eingesetzt, um Sensitivität und Inhibitortoleranz zu evaluieren.

Trotz hoher Lysatkonzentrationen konnte in allen Verdünnungen eine erfolgreiche Amplifikation nachgewiesen werden, was die hohe Robustheit gegenüber pflanzlichen Inhibitoren bestätigt. Eine einzelne, spezifische Schmelzkurve ohne unspezifische Produkte unterstreicht die hohe Assay-Spezifität. Die Proben wurden mit dem schnellen 8-Minuten-Protokoll der Plant DNA Q-Extraction Solution vorbereitet - eine effiziente DNA-Gewinnung ohne klassische Aufreinigungsschritte.

2. Benchmark der Direct-PCR-Leistung aus 10 % Tomatenlysat

Die Performance des InhibiCore Rapid Plant PCR MasterMix (5X) wurde im Vergleich zu drei konkurrierenden Mastermixen für die qPCR aus 10 % Tomatenlysat getestet. Die Proben wurden mit der Plant DNA Q-Extraction Solution vorbereitet und mittels Fluoreszenzdetektion im FAM-Kanal analysiert.
Der InhibiCore Master Mix zeigte eine erfolgreiche Amplifikation mit früher Ct-Detektion und damit die höchste Effizienz sowie beste Inhibitortoleranz im Vergleich zu den getesteten Konkurrenzprodukten. Zwei der Vergleichsmischungen zeigten ebenfalls Amplifikation, während zwei Systeme keine signifikanten Signale aufgrund starker Inhibition lieferten. Die Spezifität der Amplifikation wurde durch eine einzelne, klare Schmelzkurve ohne unspezifische Produkte bestätigt.

Abbildung 2: Direct-PCR aus Pflanzenproben – Benchmark der Inhibitorwirkung in Tomatenlysat
Die Direct-PCR wurde unter folgenden Zyklusbedingungen durchgeführt: 95 °C für 3 min, gefolgt von 40 Zyklen mit 95 °C für 10 s und 60 °C für 30 s, anschließend Schmelzkurvenanalyse.
Der InhibiCore Rapid Plant PCR MasterMix (5X) sowie Competitor N zeigten erfolgreiche Amplifikation, während Competitor T und Competitor Q stark inhibiert waren und keine zuverlässigen Amplifikationskurven lieferten. Der InhibiCore Rapid Plant PCR MasterMix (5X) zeigte den frühesten Ct-Wert aller getesteten Systeme und damit die höchste Toleranz gegenüber pflanzlichen PCR-Inhibitoren sowie die beste Performance.