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T4 DNA-Ligase

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Produktinformationen "T4 DNA-Ligase"

T4 DNA Ligase katalysiert die Bildung von Phosphodiesterbindungen zwischen 5' Phosphat and 3' Hydroxyenden in Doppelstrang DNA/RNA. 

Das Enzym kann sowohl glatte (blunt-end), als auch kohäsive DNA-Enden in duplex DNA/RNA verbinden. Es repariert Einzelstrangbrüche in Duplex DNA, RNA und DNA/RNA Hybriden.


Ligation von kohäsiven Enden:

Im Allgemeinen reicht eine 30 minütige Inkubation bei 20°C aus. Inkubationsbedingungen von 16°C für 4-16 Stunden werden aber ebenfalls regelmäßig eingesetzt. Die Ligation von glatten Enden oder von Einzelbasenüberhängen benötigt wesentlich mehr Enzym um dieselbe Effektivität wie die Ligation von kohäsiven Enden zu erreichen. Die Ligationseffizienz kann durch Zusatz von PEG oder durch Reduktion der rATP-Konzentration erhöht werden.

- T4-DNA-Ligase benötigt ATP > als Cofaktor. 
- T4-DNA-Ligase wird durch NaCL oder KCl ab einer Konzentration von 200 mM stark gehemmt.
- Um dieselbe Effizienz, wie bei der Ligation von kohäsiven Enden zu erreichen, erfordert die Ligation von blunt-end Fragmenten und Einzelbasenpaar-Überhängen etwas 50-mal mehr Enzym.
- Die Ligation von blunt-end Fragmenten kann durch Zugabe von PEG 4000 (10% w/v) Endkonzentration, Hexaminchlorid oder durch Reduzierung der ATP-Konzentration auf 50µM verbessert werden.
- Zur Verdünnung der T4-DNA-Ligase für die anschließende Lagerung bei -20 °C wird die Verwendung eines Lagerpuffers mit 50% Glycerin empfohlen.
- Zur Verdünnung der T4-DNA-Ligase für den sofortigen Gebrauch wird die Verwendung von 1x Reaktionspuffer empfohlen.

Für die PCR empfehlen wir unsere kostengünstige Taq DNA Polymerase S (M3001 >), oder unsere Pfu Proofreading Polymerase (M3004 >).


Anwendungen

• Klonierung von PCR-Produkten
• Klonierung von mit Restriktionsenzymen erzeugten DNA-Fragmenten
• Verbindung von doppelsträngigen Oligonukleotid-Linkern oder Adaptern mit DNA
• ortsspezifische Mutagenese
• Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP)
• Nick-Reparatur in Duplex-DNA, RNA oder DNA/RNA-Hybriden
• Selbstzirkulation linearer DNA.


Definition der T4-Ligase-Aktivität:

Es gibt 2 unterschiedliche Definitionen der Ligaseaktivität!

Eine Weiss unit ist definiert als Menge an Enzym die benötigt wird, um 1nmol mit 32P gelabeltes, anorganisches Pyroposphat in 20 Minuten bei 37°C in Norit* absorbierbares Material bei spezifischen Reaktionsbedingungen zu konvertieren (Weiss, B., et al., (1968) J. Biol. Chem., 243, 4543). *Norit ist eine Art aktivierter Kohlenstoff.

A Cohesive End Unit ist definiert als die Enzymmenge, die erforderlich ist, um 50% der Hind-III-Fragmente der Lambda-DNA (5'-DNA-Termini-Konzentration von 0,12µM (300µg/mL)) in 20µL 1X T4-DNA-Ligasepuffer in 30 Minuten bei 16 °C zu ligieren.

Der Umrechnungsfaktor zwischen den beiden Aktivitäten ist: Eine Cohesive End Ligation units (CEL units) entspricht 0,015 Weiss units. Eine Weiss unit entspricht somit 66,67 Cohesive End Ligation units (CEL units).

Specifications:
Activity: 166.68 CEL U/µL respective 2.5 Weiss units/µL

66.67 Weiss units equal 1 One Cohesive End Ligation Units.

Applikation:

Cloning of restriction fragments, joining linkers and adapters to blunt-ended DNA, gene (gene fragments) synthesis.

Einheiten:

A Cohesive End Unit is defined as the amount of enzyme required to give 50% ligation of Hind III fragments of lambda DNA (5´ DNA termini concentration of 0.12µM (300µg/mL)) in 20µL of 1X T4 DNA Ligase Buffer in 30 minutes at 16°C.

Quelle:

Isolated from E.coli cells infected with phage T4 amN82

Klassifizierungen:

eclass-Nr.: 32-16-04-10
Dokumente - Protokolle - Downloads :
Hier finden Sie Informationen und weiterführende Literatur. Für weitere Dokumente (Zertifikate mit weiteren Lotnummern, Sicherheitsdatenblätter in anderer Sprache, weitere Produktinformationen) wenden Sie sich bitte an Genaxxon biosience unter: info@genaxxon.com oder Tel.: +49 731 3608 123.


Dokumente:

Datenblätter
Hier finden Sie Artikel und Literaturzitate, in denen die Autoren auf die hohe Qualität dieses Genaxxonprodukts vertrauen.
Quelle: NCBI PubMed

Hier finden Sie Artikel und Literaturzitate, in denen die Autoren auf die hohe Qualität dieses Genaxxonprodukts vertrauen.
Listed below are articles and references, in which the authors trust in the high quality of this Genaxxon product.

Quelle/Source: NCBI PubMed >

The Staphylococcus aureus NuoL-Like Protein MpsA Contributes to the Generation of Membrane Potential

Sonja Mayer, Wojtek Steffen, Julia Steuber, Friedrich Götz

J Bacteriol. 2015 Mar; 197(5): 794–806. Prepublished online 2014 Dec 1. Published online 2015 Feb 4. doi: 10.1128/JB.02127-14

PMCID: PMC4325100

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Accessory Items

Pfu DNA Polymerase from Genaxxon

Die High-Fidelity Pfu proofreading DNA Polymerase ist eine thermostabile, hochprozessive 5' - 3' DNA Polymerase mit zusätzlicher 3' - 5' Exonukleaseaktivität (proofreading), die es der Polymerase ermöglicht, Fehler im Nukleotideinbau zu korrigieren. Die Genaxxon bioscience Pfund High-Fidelity DNA Polymerase ist die rekombinante Form der ursprünglich aus dem thermophilen Archaebakterium Pyrococcus furiosus (Pfu) beschriebenen Polymerase. Das entsprechende Gen wurde kloniert und in E.coli exprimiert. Das Enzym hat keine nachweisbare 5' - 3' Exonukleaseaktivität. Pfu DNA Polymerase zeigt eine erhöhte Thermostabilität und zusätzlich eine um den Faktor 10 höhere Genauigkeit gegenüber Taq-Polymerase. Einmaliges Testmuster zum Sonderpreis erhältlich! Keine Versandkosten bei Versand innerhalb Deutschlands! Der Testmusterpreis wird bei der ersten offiziellen Bestellung des Produkts zurückerstattet. Besonderheiten: 10-fach höhere Genauigkeit gegenüber Taq Polymerase High-Fidelity Polymerase Proofreading Funktion (3' - 5' Exonukleaseaktivität) Hohe Thermostabilität, Halbwertszeit bei 100°C deutlich höher als bei Taq Polymerase Generiert Blunt-End PCR-Produkte Erzeugt PCR-Produkte für Klonierung und Expression Modifizierte Nukleotide können problemlos verwendet werden Weitere High-Fidelity Proofreading Polymerasen von Genaxxon bioscience:- M3003 ReproFast Proofreading Polymerase- M3002 Pwo Proofreading Polymerase- M3012 ReproHot (KOD) Proofreading Polymerase- AQ97 High Fidelity proofreading Polymerase Mit unseren hochwertigen dNTPs als Set (M3015) oder als Mix (M3016) oder unseren DNA-Markern und unserer günstigen Standardagarose bieten wir Ihnen weitere Produkte für die PCR.

Regulärer Preis: Ab 45,00 €
Taq Polymerase from Genaxxon

Die High-quality Taq DNA Polymerase S für hohe Selektivität ist eine hochprozessive 5' - 3' DNA-Polymerase ohne 3' - 5'-Exonukleaseaktivität. Der Puffer ist für eine hohe Selektivität bei der Amplifikation optimiert. Die hohe Prozessivität der Genaxxon Taq-Polymerase erlaubt die Amplifikation von DNA-Fragmenten bis zu >7 kBasen. Die Polymerase wird mit 10fach Puffer und separatem MgCl2 geliefert. Der mitgelieferte 'complete buffer' enthält 15mM MgCl2. Taq DNA Polymerase Testmuster erhältlich! Keine Versandkosten bei Versand innerhalb Deutschlands! Mit unseren hochwertigen dNTPs als Set (M3015.4100 und M3015.0250) > oder als Mix (M3016.1010) > oder unseren DNA-Markern > und unserer günstigen Standardagarose > bieten wir Ihnen weitere qualitativ hochwertige Produkte für die PCR.

Regulärer Preis: 50,00 €
Taq Polymerase from Genaxxon

Die High-quality Taq DNA Polymerase E mit Ammoniumsulfatpuffer für hohe Ausbeute ist eine hochprozessive 5' - 3' DNA Polymerase ohne 3' - 5' Exonukleaseaktivität. Der Puffer mit Ammoniumsulfat ist für eine hohe Ausbeute bei der Amplifikation optimiert. Die hohe Prozessivität der Genaxxon Taq-Polymerase erlaubt die Amplifikation von DNA-Fragmenten bis zu >7 kBasen. Die Polymerase wird mit 10fach-Ammoniumsulfat Puffer und separatem MgCl2 geliefert. Der mitgelieferte 'complete buffer' enthält 25mM MgCl2. Taq DNA Polymerase Testmuster erhältlich! Keine Versandkosten bei Versand innerhalb Deutschlands! Mit unseren hochwertigen dNTPs als Set (M3015.4100 und M3015.0250) > oder als Mix (M3016.1010) > oder unseren DNA-Markern > und unserer günstigen Standardagarose > bieten wir Ihnen weitere qualitativ hochwertige Produkte für die PCR.

Regulärer Preis: 50,00 €