5-ROX (5-Carboxy-X-rhodamin) - reines Isomer

ROX wird als passiver Referenzfarbstoff verwendet, um Unterschiede in der Fluoreszenz zwischen den Wells auszugleichen, die nichts mit der PCR zu tun haben, also zur Normalisierung des fluoreszierenden Reportersignals in quantitativer Realtime PCR (qPCR) oder RT-PCR. Unterschiede in der Fluoreszenz können z.B. auftreten aufgrund von Variationen in der Lichtintensität zwischen den Wells, die von der optischen Konstruktion der PCR-Maschine herrühren, oder durch Pipettierunterschiede. Die ROX Fluoreszenz ändert sich nicht im Verlauf der PCR-Reaktion, stellt aber eine stabile Basislinie dar, auf die die Proben genormt sind. Anregung und Emission des Referenzfarbstoffs liegen bei 584nm und 612nm. Die Konzentration, die verwendet wird, hängt ab vom Realtime qPCR-Instrument oder, genauer gesagt, von dem verwendeten Filter. Bei älteren Realtime qPCR-Maschinen gibt es noch keine exakt für die ROX Fluoreszenz passenden Filter. Daher werden bei diesen Maschinen hohe Konzentrationen an ROX benötigt. Einige neuere Maschinen brauchen keinerlei internen Standard, um Unterschiede in der Lichtintensität auszugleichen. Dennoch könnte ein interner Standard nützlich sein, um Variationen beim Pipettieren zu korrigieren. Dieser Referenzfarbstoff ist qualifiziert für die Verwendung auf Instrumenten wie ABI PRISM® 7700, One-Step System, RotorGene und vielen anderen. Bitte beachten Sie die Bedienungsanleitung der jeweiligen qPCR-Maschine im Hinblick auf die adäquate Menge an ROX. Ready-to-use qPCR Mastermixe mit hoher Konzentration an ROX (High ROX, 500nM), niedriger Konzentration Low ROX (50nM) oder ohne ROX stehen Ihnen bei Genaxxon zur Verfügung (qPCR >).

5/6-ROX (5/6-Carboxy-X-rhodamin) gehört zu den Rhodaminfarbstoffen. Rhodaminfarbstoffe sind im Gegensatz zu Fluoresceinen über einen größeren pH-Bereich stabil und stabiler gegenüber Photobleaching. Das relativ langwellige Emissionsmaximum macht ROX zu einem attraktiven Farbstoff für Multiplex-Detektionssysteme. Derivate von ROX finden Anwendung in der Markierung von Peptiden, Proteinen und anderen biologischen Liganden. 5-ROX >, 6-ROX > und deren Mischung 5/6-ROX > werden verwendet bei der Markierung von Biomolekülen durch EDC-vermittelte Reaktionen. Succinimidylester mit dem Derivat 5/6-Carboxy-X-rhodamin (S5421 5(6) Carboxy-X-rhodaminsuccinimidylester / 5(6) ROX SE >) werden häufig verwendet für die Oligonukleotid-Markierung und für automatisierte Anwendungen in der DNA-Sequenzierung.Genaxxon bioscience bietet ein großes Spektrum an Fluoreszenzfarbstoffen > für die Gestaltung Ihrer Sonde oder für andere Forschungszwecke. Andere Fluoreszenzfarbstoffe > von Genaxxon: S5409 FAM >, S5410 5/6-TAMRA >, S5439 DAF-2 >, etc. Reference: P.J. Finn et al.; Nucleic Acids Res. 30, 2877 (2002), (2) J.M. Bartlett et al.; Mol Biotechnol 13, 185 (1999), (3) S.C. Hung et al.; Anal Biochem 255, 32 (1998).

4,5-Diaminofluoresceindiacetat (DAF-2 DA) ist ein hochsensitives zellpermeables Nachweisreagenz für die Echtzeitmessung von NO in lebenden Zellen. Anwendungen: DAF-2DA ist wahrscheinlich der erfolgreichste Indikator für NO. Wie andere Fluoresceindiazetate ist DAF-2 Diazetat membrangängig und wird durch intrazelluläre Esterasen zu 4,5-Diaminofluorescein (DAF-2) deacetyliert. DAF-2 DA kann für die fluorometrische Detektion und die Fluoreszenzmikroskopie von NO benutzt werden um Echtzeitänderungen im NO-Gehalt in vivo zu messen. Referenzen: (1) V.M. Dirsch et al.; Biol. Proc. Online 5(1), 136 (2003), (2) N. Nagata et al.; J. Biochem. 125(4), 658 (1999), (3) H. Kojima et al.; Anal. Chem. 70(13), 2446 (1998), (4) H. Kojima et al.; Chem. Pharm. Bull. 46, 373 (1998), (5) H. Kojima et al.; Neuroreport 9, 3345 (1998).

5/6-TAMRA ist das Isomerengemisch von Carboxytetramethylrhodamin (TMR). Das nichtaktivierte Carboxytetramethylrhodamin wird als roter Fluoreszenzfarbstoff für die Derivatisierung von Proteinen und alkylaminomodifizierten Nukleinsäuren sowie zur Markierung von Oligonukleotiden verwendet. Die Fluoreszenzausbeute von TAMRA beträgt ca. ein Viertel von Fluoresceinkonjugaten. Trotzdem erscheinen TAMRA-Konjugate heller als die korrespondierenden Fluorescein-Derivate aufgrund der Tatsache, dass TAMRA leicht durch die 546nm Spektrallinie von Quecksilberdampflampen angeregt wird. Gleichzeitig ist es an sich deutlich photostabiler als Fluorescein. Der Fluoreszenzfarbstoff wird auch sehr effektiv durch die 543nm Spektrallinie von grünem Ne-Laser angeregt. Succinimidylester von 5-TAMRA >, 6-TAMRA > oder der gemischten 5/6-TAMRA Isomere > sind die Markierungsreagenzien der Wahl zur Herstellung von fluoreszierenden Biokonjugaten, einschließlich Peptid-, Protein-, Nukleotid- und Nukleinsäurekonjugaten, insbesondere für in der Immunchemie verwendete fluoreszierende Antikörper und Avidinderivate. Diese Fluoreszenzfarbstoffe finden auch Verwendung als Akzeptoren für FAM-Fluorophore > in FRET-Studien.Weitere Fluoreszenzfarbstoffe von Genaxxon: 5/6-TAMRA >, 5-TAMRA >, FAM >, ROX >, DAF-2 >.

6-ROX (6-Carboxy-X-rhodamin) gehört zu den Rhodaminfarbstoffen. Rhodaminfarbstoffe sind im Gegensatz zu Fluoresceinen über einen größeren pH-Bereich stabil und stabiler gegenüber Photobleaching. Das relativ langwellige Emissionsmaximum macht ROX zu einem attraktiven Farbstoff für Multiplex-Detektionssysteme. Derivate von ROX finden Anwendung in der Markierung von Peptiden, Proteinen und anderen biologischen Liganden. 5-ROX >, 6-ROX > und deren Mischung 5/6-ROX > werden verwendet bei der Markierung von Biomolekülen durch EDC-vermittelte Reaktionen. Succinimidylester mit dem Derivat 5/6-Carboxy-X-rhodamin (S5421 5(6) Carboxy-X-rhodaminsuccinimidylester / 5(6) ROX SE >) werden häufig verwendet für die Oligonukleotid-Markierung und für automatisierte Anwendungen in der DNA-Sequenzierung.Genaxxon bioscience bietet ein großes Spektrum an Fluoreszenzfarbstoffen > für die Gestaltung Ihrer Sonde oder für andere Forschungszwecke. Andere Fluoreszenzfarbstoffe > von Genaxxon: S5409 FAM >, S5410 5/6-TAMRA >, S5439 DAF-2 >, etc. Reference: P.J. Finn et al.; Nucleic Acids Res. 30, 2877 (2002), (2) J.M. Bartlett et al.; Mol Biotechnol 13, 185 (1999), (3) S.C. Hung et al.; Anal Biochem 255, 32 (1998).