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Agarose LE - Standardagarose

Vorteile im Überblick

  • Standard agarose
  • Standard Melting Point
  • Separation range: 100bp to 25kbp
  • Low EEO

Kauf 3 - Zahl 2
Anzahl Stückpreis
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Gewicht
Produktnummer: M3044.0100
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Produktinformationen "Agarose LE - Standardagarose"

Agarose LE ist eine Standardagarose zur Trennung von DNA im Größenbereich zwischen 100bp und 25kbp. Sie besitzt einen sehr niedrigen EEO-Wert und zeichnet sich durch eine niedrige DNA-bindende Aktivität aus. Sie wird besonders für die Herstellung präparativer und analytischer Gele in der Routine-Gelelektrophorese verwendet. Je nach Konzentration der Standardagarose LE variiert der Größenbereich bei der Nukleinsäuretrennung zwischen 100bp und 25kbp. Der niedrige EEO-Wert ermöglicht eine breite Palette von Anwendungen: PCR-Produktanalysen, Restriktionsenzymanalysen, Trennung von RNA vor dem Blotting usw.

Diese Agarose ist vergleichbar mit der Agarose BioRagent, low EEO von Sigma oder mit der Universal-Agarose, peqGOLD von Peqlab.
Einmaliges kostenloses Agarose Testmuster erhältlich. Keine Versandkosten bei Versand innerhalb Deutschlands!

Genaxxon bietet Agarosen für verschiedenste Anwendungen. Es gibt Agarosen mit unterschiedlichem Schmelzpunkt oder aber mit normalen bzw. hochauflösenden Trenneigenschaften von DNA-Fragmenten.

Unsere Standardagarose (M3044) mit normalem Schmelzpunkt und Standardtrenneigenschaften ist mit einem sehr großen Trennbereich von 100bp bis 25kbp eine optimale Lösung für die Routine. Diese Agarose ist sowohl als Pulver als auch als hochwertige, vielseitig einsetzbare Tabletten (M3054 >) in Blisterverpackung (200 oder 1.000 Tabletten) erhältlich. Diese Tabletten sind vorgewogen und daher sofort ohne wiegen mit Staubentwicklung einsetzbar.

Die niedrig schmelzenden Agarosen sind speziell für die schnelle Extraktion von DNA aus Gelen zum Verdau mit β-Agarase oder aber für die "in-gel" DNA-Bearbeitung mit Enzymen für die bakterielle Transformation mit Nukleinsäuren gedacht.

Die hochauflösenden Agarosen (normal schmelzend oder niedrig schmelzend) sind für die extrem gute Separation/Auflösung von DNA-Fragmenten gedacht, die sich nur durch eine Größe von 2bp unterscheiden: M3046 Agarose Tiny > (niedrig schmelzend, hohe Auflösung vergleichbar mit NuSieve®) oder M3047 Agarose Tiny HT > (mit hoher Gelstärke, hohem Schmelzpunkt und hoher Auflösung entsprechend der SeaKem® Agarose).

Zum ungiftigen Anfärben von Nukleinsäuren im Agarosegel wird der hochsensitive Fluoreszenzfarbstoff SafeGel red stain (M3193) oder SafeGel green stain (M3191) empfohlen.

FAQs
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Die Porengröße des Agarosegels hängt von der Konzentration der Agarose ab. Höhere Konzentrationen führen zu kleineren Poren und einem festeren Gel, was die Trennung größerer DNA-Fragmente beeinflusst. Niedrigere Konzentrationen ergeben ein weicheres Gel mit größeren Poren für kleinere Fragmente.
Die Wahl der richtigen Agarose hängt von der Größe der DNA- oder RNA-Fragmente ab, die Sie trennen möchten, sowie von der Art der geplanten Anwendung. Genaxxon bietet eine Vielzahl von Agarosen, darunter Standardagarose, hochauflösende Agarose und Low-Melting-Agarose, die für verschiedene Anwendungen wie Blotting, PFGE, In-Gel-Analysen und mehr geeignet sind. Falls Sie sich unsicher sind, welche Agarose die richtige für Ihre Anwendung ist, können Sie gerne unseren technischen Support unter info@genaxxon.com kontaktieren.
Für die Trennung kleiner DNA-Fragmente oder für hochauflösende Anwendungen sind hochauflösende Agarosen ideal. Diese Agarosen können Unterschiede von nur wenigen Basen (2-3 bp) sichtbar machen und eignen sich hervorragend für Allel-Sizing-Experimente oder Mutationsanalysen. Genaxxon bietet zwei hoch-auflösende Agarosen an: M3046 – Agarose Tiny und M3047 – Agarose Tiny HT.
Low-Melting-Agarose hat einen niedrigeren Schmelzpunkt und eignet sich besonders für die schnelle Extraktion von DNA aus Gelen sowie für In-Gel-Verarbeitungen. Sie ist außerdem ideal für die Re-Isolation von DNA und RNA und die Durchführung von Phage-Plaque-Tests. Genaxxon bietet zwei low-melting Agarosen an: M3046 – Agarose Tiny und M3049 - Agarose LM – low melting.
Low-Melting-Agarose eignet sich besonders für die Verwendung in Zellkulturen, z. B. bei Phage-Plaque-Assays. Sie hilft bei der schnellen Extraktion von DNA und wird in der Zellkultur verwendet, um Viruskonzentrationen zu testen. Genaxxon bietet für diese Anwendungen die M3049 – Agarose LM – low melting an.
Für Blotting-Experimente, wie Southern Blotting, empfiehlt Genaxxon Agarosen wie Agarose LE (M3044)Agarose Tiny HT (M3047) und Agarose Mega (M3051), die eine präzise Trennung und Übertragung der DNA auf eine Membran ermöglichen.
Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) ist eine Methode zur Trennung von DNA-Fragmenten größer als 30 kb. Genaxxon empfiehlt für PFGE die Agarose Mega (M3051), die eine bessere Auflösung von großen DNA-Fragmenten ermöglicht.

Specifications:
Electroendosmosis (EEO): <0.12
Sulfate: <0.2%
Gel strength (1.0%): >1000 g/cm2
Gel strength (1.5%): >2300 g/cm2
Gelling temperature: +36°C (+/- 1.5°C)
Melting temperature: <89°C
Water content: <9%
pH-value in water: 6.0 to 7.0 (1% in water)
DNAses and RNAses: not detected.
DNA binding: not detected


Applikation / Application:
For analytical and preparative DNA gel electrophoresis

Einheiten / Units:
Quelle / Source:
seaweed


Sicherheits Hinweise / Safety


Klassifizierungen / Classification

EC-Nr: 232-731-8
CAS-Nr: 9012-36-6
eclass-Nr: 32-16-04-03
Dokumente - Protokolle - Downloads :
Hier finden Sie Informationen und weiterführende Literatur. Für weitere Dokumente (Zertifikate mit weiteren Lotnummern, Sicherheitsdatenblätter in anderer Sprache, weitere Produktinformationen) wenden Sie sich bitte an Genaxxon biosience unter: info@genaxxon.com oder Tel.: +49 731 3608 123.


Dokumente:

Sicherheitsdatenblätter
Zertifikate
Spez. Produktbeschreibung
Allg. Daten 1
Allg. Daten 2
Hier finden Sie Artikel und Literaturzitate, in denen die Autoren auf die hohe Qualität dieses Genaxxonprodukts vertrauen.
Quelle: NCBI PubMed

Impact of the Voltage-Gated Calcium Channel Antagonist Nimodipine on the Development of Oligodendrocyte Precursor Cells.
Michael Enders, Alicia Weier, Rittika Chunder, Young An, Franziska Bremm, Andreas Feigenspan, Christian Buettner, Arif B. Ekici, Enrico Mingardo, Benjamin Odermatt, Stefanie Kuerten
Int J Mol Sci. 2023 Feb;24(4):3716.
doi: 10.3390/ijms24043716.
PMCID: PMC9960570.

Induced Variations in Brassinosteroid Genes Define Barley Height and Sturdiness, and Expand the Green Revolution Genetic ToolkitChristoph Dockter, Damian Gruszka, Ilka Braumann, Arnis Druka, Ilze Druka, Jerome Franckowiak, Simon P. Gough, Anna Janeczko, Marzena Kurowska, Joakim Lundqvist, Udda Lundqvist, Marek Marzec, Izabela Matyszczak, André H. Müller, Jana Oklestkova, Burkhard Schulz, Shakhira Zakhrabekova, Mats Hansson
Plant Physiol. 2014 Dec; 166(4): 1912–1927. 
doi: 10.1104/pp.114.250738
PMCID: PMC4256852

The role of rotavirus associated with pediatric gastroenteritis in a general hospital in Lagos, Nigeria
Philip Ifesinachi Anochie, Edwina Chinwe Onyeneke, Emmanuel Osaretin Asowata, Ebelechukwu Afocha, Anthony Chidiebere Onyeozirila, Angelina Chinyere Ogu, Bestman Chukwuemeka Onyeneke
Germs. 2013 Sep; 3(3): 81–89. 
doi: 10.11599/germs.2013.1041
PMCID: PMC3882862

Connectivity from OR37 expressing olfactory sensory neurons to distinct cell types in the hypothalamus
Andrea Bader, Bettina Klein, Heinz Breer, Jörg Strotmann
Front Neural Circuits. 2012; 6: 84.
doi: 10.3389/fncir.2012.00084
PMCID: PMC3499762


Kurzanleitung für ein Standard-Agarosegel (2%-ig, 100mL)

  • 2g Agarose LE in ein hitzebeständiges Gefäß einwiegen.
  • In einem 1L-Kolben eine 1%-ige TAE-Lösung herstellen (z.B. 20mL 50X gebrauchsfertige TAE-Pufferlösung > auf 1000mL Aqua dest. auffüllen), gut verrühren.
  • Von dieser Lösung 100mL zu der Agarose geben, leicht schwenken, bis sich die Agarose in der Flüssigkeit verteilt hat.
  • Diese Agaroselösung vorsichtig in kurzen Intervallen in der Mikrowelle erhitzen, bis sich die Agarose vollständig gelöst hat. Es entsteht eine klare Lösung.
  • Vorsicht: Die Lösung kann beim Erhitzen leicht überkochen, immer beobachten und kurze Intervalle wählen!
  • Vorsicht: Lösung wird sehr heiß, Handschuhe verwenden! Siedeverzug vermeiden! Schutzbrille tragen!
  • Die Lösung sollte auf ca. 50-60°C abgekühlt werden (Glas kann gerade noch angefasst werden).
  • Je nach Anwendung wird ein Gelfarbstoff, z.B. SafeGel red stain (~10µL je 100mL Gel, je nach geünschter Intensität der Banden,) in das Gel gegeben und gleichmäßig verteilt.
  • Die Lösung wird nun vorsichtig in den vorbereiteten Schlitten (mit Kamm) einer Elektrophoresekammer gegossen.
  • Vorsicht: Wenn die Gellösung noch zu heiß ist, besteht die Gefahr, dass sie durch ungenügend abgedichtete Ritzen des Schlittens ausläuft oder der Schlitten bricht! Bei zu stark abgekühlter Lösung geliert das Gel bereits!
  • Das Gel für ca. 1 Stunde erstarren lassen.
  • Der Rest des 1X TAE-Puffers wird in die vorbereitete Elektrophoresekammer gegeben und das Gel mit Schlitten in die entsprechende Position gelegt (Taschen sind oben). Das Gel muss vollständig mit Flüssigkeit bedeckt sein. Der Kamm wird vor der Elektrophorese gezogen.
  • Vor dem Auftragen der Proben wird ein Spülen der Taschen mit dem Laufpuffer empfohlen, um Gelreste zu entfernen.
  • Wichtig: Die TAE-Konzentration des Elektrophoresepuffers (Laufpuffer) muss mit der Konzentration im Gel übereinstimmen!
  • Das PCR-Produkt wird mit Ladepuffer (z.B. DNA Ladepuffer I >) gemischt (6X-Ladepuffer: 5µL Produkt + 1µL Ladepuffer) und vorsichtig in die Taschen gegeben.
  • Der Schritt des Mischens mit einem Ladepuffer entfällt bei Verwendung von einem Mastermix in der PCR, bei dem bereits ein Ladepuffer integriert ist (z.B. Genaxxons RedMasterMix 2X Taq PCR Mastermix mit rotem Farbstoff >).
  • Es wird das zusätzliche Auftragen eines DNA-Größenmarkers empfohlen (z.B. GenLadder 100bp + 1.5kb, ready-to-use >), ca. 5-6µL pro Bahn.
  • Je nach Vorgaben des Geräteherstellers kann die Gelelektrophorese nun nach Anbringen der Elektroden gestartet werden. Die negativ geladene DNA wird in Richtung des positiven Pols wandern.
    Beispiel: 120V, 160 mA, 50W.
    Die Laufzeit richtet sich nach dem gewünschten Ergebnis (durchschnittlich 0,5-1 Stunde). Mit einem Fotodokumentationsgerät kann das Ergebnis festgehalten werden.

Agarosen - für jede Anwendung eine Lösung von GENAXXON

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